目前由政府倡导并力图在全国农村实施的合作医疗制度的特点

第一，政府出面组织并进行引导。由于建立农村合作医疗制度已经成为政府目标，因此各级政府将予以更大关注。虽然该制度的建设不能单靠行政手段，但绝不放任自流，政府将通过宣传教育，动员农民积极参加。
第二，该制度实行“以个人投入为主、集体扶持、政府适当支持”的资金筹集模式，这既不同于60年代至70年代个人基本不缴费的合作医疗制度，也不同于完全的个人保险模式。政府、集体扶持和群众互助互济，由集体和个人分担医疗费用是新型合作医疗制度的主要内容。
第三，加强科学管理和民主监督。由于实行个人和集体共担费用的办法，对资金的科学管理和对制度运行的民主监督就是必需的。这不但可以避免医疗中的违规行为，而且可以提高资金利用效率，其目的是使农民真正受益。
第四，因地制宜。由于各地经济发展程度不同，发展合作医疗的基础不同，政府并未对全国农村的合作医疗制度作统一规定，而是强调在筹集方式、管理水平（层次）、基金筹集标准及补偿比例等方面因地制宜，建设符合本地经济社会发展水平的合作医疗制度。
很明显，建立农村合作医疗制度是一项十分艰巨的任务。但是这是一项利国利民的事业。它必将在政府的组织和领导下，获得广大农民的认同和参与，广大农村居民也因此受惠。这也是农村社会进步的具体体现。

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