根据我国《民事诉讼法》，当事人申请司法确认调解协议，由双方当事人依法共同向（）基层人民法院提出。

《民事诉讼法》第194条："申请司法确认调解协议，由双方当事人依照人民调解法等法律，自调解协议生效之日起三十日内，共同向调解组织所在地基层人民法院提出"。故D为正确选项。