简答题

在MEGA2软件中,提供了哪些碱基替换距离模型,试列举其中3种,解释其含义。

正确答案

碱基替换模型包括,No.ofdifferences、p-distance、Jukes-Cantordistance、Tajima-Neidistance、Kimur2-parameterdistance、Tamura3-parameterdistance、Tamura-Neidistance
p-distance:表示有差异的核苷酸位点在序列中所占比例,将有差异的核苷酸位点数除已经比对的总位点数就可以得到
Jukes-Cantor:模型假设ATCG的替换速率是一致的,然后给出两个序列核苷酸替换数的最大似然估计
Kimura2-parameter:模型考虑到了转换很颠换队多重击中的影响,但假设整个序列中4钟核苷酸的频率是相同哈德在不同位点上的碱基替换频率是相同的

答案解析

相似试题
  • 在基因的置换突变中同类碱基(嘧啶与嘧啶、嘌呤与嘌呤)的替换称为()。不同类型碱基(嘧啶与嘌呤)间的替换称为()。

    填空题查看答案

  • 分子的()速率是指核酸或蛋白质等生物大分子在进化的过程中碱基或氨基酸发生替换的频度,它是测定生物大分子进化快慢的尺度,时间以年为单位。

    填空题查看答案

  • 碱基替换是基因突变的重要分子基础之一。碱基转换指的是()

    单选题查看答案

  • 碱基替换是基因突变的重要分子基础之一。碱基颠换指的是()

    单选题查看答案

  • 简述碱基替换可引起四种不同效应?

    简答题查看答案

  • 碱基替换

    名词解析查看答案

  • 什么是极性突变?为什么说极性突变不是缺失突变、点突变和不是碱基对替换所致?

    简答题查看答案

  • DNA双螺旋的直径是()Å,各对碱基上下之间的距离为()Å,每个螺旋距是()Å,每个螺旋包括()对碱基。

    填空题查看答案

  • MEGA2如何将其它多序列比对格式文件转化为MEGE格式的多序列比对文件?

    简答题查看答案