简答题

简述PAM矩阵与BLUSUM矩阵的关系

正确答案

（1）两者都在打分系统中使用对数比值；
（2）PAM矩阵是基于近相关蛋白家族数据的，并且假设高度相关蛋白的取代概率可以外推到远相关蛋白的概率。BLOSUM矩阵是基于实际观测到的远相关蛋白比对。
（3）高值BLOSUM矩阵和低值PAM矩阵最适合于研究高度保守的蛋白；低值BLOSUM矩阵和高值PAM矩阵最适合检测远相关蛋白。
（4）一般来说，在局部相似性搜索上，BLOSUM矩阵较PAM要好。对于数据库搜索来说一般选择BLOSUM62矩阵。PAM矩阵可用于寻找蛋白质的进化起源，BLOSUM矩阵用于发现蛋白质的保守域。

答案解析

略

相似试题

模块替换矩阵（BLUSUM）
名词解析查看答案
模块替换矩阵（BLUSUM）
名词解析查看答案
什么是序列比对中使用的PAM矩阵和BLOSUM矩阵，它们的作用是什么，一般BLAST选择使用的矩阵是什么
简答题查看答案
PAM矩阵
名词解析查看答案
已知随机向量（X，Y）的协方差矩阵V为求随机向量（X—Y，X＋Y）的协方差矩阵与相关系数矩阵。
简答题查看答案
可以产生由Z2上n阶线性常系数齐次递推关系式的矩阵A称为什么？（）
单选题查看答案
已知随机向量（X，Y）的协方差矩阵V为求随机向量（X＋Y，X—Y）的协方差矩阵与相关系数矩阵。
简答题查看答案
已知随机向量（X，Y）的协方差矩阵V为求随机向量（X＋Y， X—Y）的协方差矩阵与相关系数矩阵。
简答题查看答案
已知随机向量（X，Y）的协方差矩阵V为求随机向量（X—Y， X＋Y）的协方差矩阵与相关系数矩阵。
简答题查看答案

语音搜题

拍照搜题

打赏

理学

简述PAM矩阵与BLUSUM矩阵的关系

正确答案

答案解析