CsCl-EB法是一种沉降平衡离心法,至今仍是质粒DNA纯化的标准方法。经超速离心,离心介质CsCl形成一连续的密度梯度,在过量EB存在的条件下,各种不同密度的物质经离心平衡后得以分开。蛋白质由于密度小(1.3~1.49/cm
)而浮于液面,RNA密度大而沉于管底,各种DNA密度介于蛋白质与RNA之间,处于中部。细菌染色体DNA与不同分子构型的质粒DNA的密度均为1.79/cm
左右,难以区分,经过量EB处理后,不同分子构型的DNA与EB的结合能力不一样,因而密度下降不一致,可将它们有效分离开。