从光源、透镜、成像和分辨力四方面比较电镜和光镜。

电镜和光镜从光源、透镜、成像和分辨力四方面不同。
（1）光源的不同：光学显微镜利用可见光作为光源，照明部分包括反光镜、聚光镜和光阑，可对入射光线进行集光并调节其强弱。电镜是以电子束代替光源，以一根钨丝作为阴极发射电子，电子受到阳极吸引而加快速度，加速的电子通过阳极的微孔形成电子束，构成照明源。
（2）透镜的不同：光学显微镜的透镜由物镜、目镜组成，每种镜头由2～3个玻璃透镜构成，由于可见光能在空气中直线前进，所以玻璃透镜可直接在空气中工作。电子显微镜使用产生轴对称磁场的精密线圈作为电磁透镜，以电磁场透镜代替玻璃透镜，但因为电子撞击空气分子将发生散射而不能直线前进，所以，镜筒中的空气必须抽出，保持高度真空。
（3）成像的不同：光学显微镜是通过物镜和目镜的—组玻璃透镜将标本上的微小物体放大成像。在电子显微镜下，标本通过一个气闸送入真空镜筒，经聚光镜汇聚的平行电子束被物镜、中间镜和投影镜多级放大，最后在荧光屏上成像即时观察，或投射到照相底片上成像使底片感光作为永久记录。
（4）分辨力不同：光学显微镜分辨力可达200nm（油镜），电子显微镜分辨力为0.1nm。

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