先导化合物的发现主要有以下四种方法:
1.已知生物活性物质的修饰和改良:
如喹诺酮类抗菌药物的亚砜类电子等排(flosequinan),几乎无抗菌活性,但是却发现其具有较强的血管扩张作用,因此被用作强心药。
Norfloxacin(喹诺酮类抗菌剂)→ Flosequinan(血管扩张剂)
2.利用特定的生物学评定方法对任意选定的化合物的筛选(幸运发现、药物合成中间体、组合化学)。
这其中可再分为: 广泛筛选与偶然发现、彻底筛选与随机筛选、组合化学与高通量筛选、药物合成中间体作为先导化合物。
3.充分利用生物学、医学领域的新发现以及偶然发现的各种生物信息(内源性活性物质、药物代谢产物、临床副作用)。
包括在人体观察到的现象,从动、植物、微生物中的发现,也就是天然产物中活性成分的分离。
4.以与病理学异常有关的分子知识为基础,对新的生理活性物质进行合理设计。
主要通过研究生理机制,从生命基础过程研究中发掘模型先导化合物,最近研究较为热门的分子靶点有:
A.与抗肿瘤药物相关的靶点: 有很多新型的肿瘤药物作用靶点,比较常见的包括与肿瘤血管生成相关的整合素、与肿瘤多药耐药性有关的p-糖蛋白、法尼基转移酶等;
B.与精神、神经系统药物相关的靶点: 包括促皮质释放因子(CRF)受体、与神经细胞调往有关的Caspases以及聚ADP-核糖聚合酶[poly(ADP-ribose)polymerase,PARP]等;
C.与代谢相关的药物靶点: 这类靶点与许多疾病相关联,比较重要的包括PPARs受体、FAS以及Orexins受体等。